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BioDM (BioDBS)

Anika Groß, Dr. Michael Hartung

Die Vorlesung findet donnerstags statt.

  • Vorlesungsbeginn: 11.04.2013
  • Uhrzeit: 09.15-10.45
  • Ort: SG 3-10

Klausur:

Die Abschlussklausur findet Mittwoch, den 24.07.2013, um 9:00 Uhr im Hörsaal 6 (Hörsaalgebäude) statt. Die Anmeldung erfolgt über OLAT.

Zur Anwendung des Vorlesungsstoffes werden Online-Übungen im E-Learning-System LOTS in der Gruppe “BioDM_SS2013” angeboten. Um der Gruppe in LOTS beizutreten geben Sie als Kennung biodm#ss13 ein (siehe auch LOTS-Hinweise).

Teilnehmerkreis:

Studenten der Informatik, Studenten anderer Fachrichtungen

Übersicht:

Die Vorlesung “Bio Data Management” (BioDM) behandelt Datenbanken im Bereich der Bioinformatik sowie typische Verfahren und Algorithmen zur Datenverwaltung, Datenanalyse, etc..

Gliederung

KapitelThema
0 Organisation/Inhalt
1 Motivation und Grundlagen
2 Bio-Datenbanken
3 Datenmodelle und Anfragesprachen
4 Modellierung von Bio-Datenbanken
5 (a) Sequenzierung und Alignments , (b) NGS Data Management
6 Genexpressionsanalyse
7 Datenintegration: Ansätze und Systeme
8 Annotationen
9 Schema- und Ontologiematching
10 Versionierung von Datenbeständen

Erwartete Vorkenntnisse:

Vorlesung Datenbanksysteme I

Scheinvergabe:

nein; Abschlußprüfung

Vorlesung
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