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BioDM

Dr. Anika Groß

Die Vorlesung findet donnerstags statt.

  • Vorlesungsbeginn: 16.10.2014
  • Uhrzeit: 09.15-10.45
  • Ort: HS 19
  • Die Abschlussklausur findet Montag, den 16.02.2014, um 11:00 Uhr im Hörsaal 1 (Hörsaalgebäude) statt. Die Anmeldung erfolgt über OLAT.

Zur Anwendung des Vorlesungsstoffes werden Online-Übungen im E-Learning-System LOTS in der Gruppe “BioDM_WS2014” angeboten. Um der Gruppe in LOTS beizutreten geben Sie als Kennung biodm#ws14 ein (siehe auch LOTS-Hinweise).

Teilnehmerkreis:

Studenten der Informatik, Studenten anderer Fachrichtungen

Übersicht:

Die Vorlesung “Bio Data Management” (BioDM) behandelt Datenbanken im Bereich der Bioinformatik sowie typische Verfahren und Algorithmen zur Datenverwaltung, Datenanalyse, etc..
Die notwendigen Kenntnisse aus dem Bereich Biologie werden in den Grundlagen vermittelt, d.h. es sind keine speziellen Vorkenntnisse aus den Bio-Wissenschaften erforderlich.

Gliederung

KapitelThema
0 Organisation/Inhalt
1 Motivation und Grundlagen
2 Bio-Datenbanken
3 Datenmodelle und Anfragesprachen (update 2.11.)
4 Modellierung von Bio-Datenbanken (update 20.11.)
5 (a) Sequenzierung und Alignments , (b) NGS Data Management
6 Genexpressionsanalyse
7 Annotationen
8 Datenintegration
9 Ontologiematching + Zusatz UMLS
10 Versionierung von Datenbeständen

Erwartete Vorkenntnisse:

Vorlesung Datenbanksysteme I

Scheinvergabe:

nein; Abschlußprüfung

Vorlesung
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