Seminar Bio-Datenbanken WS02/03
Prof. Dr. E. Rahm:
Seminar "Bio-Datenbanken" (WS 02/03)
Inhaltsübersicht
Die Studenten gewinnen einen Einblick in die spannende Nutzung von Datenbanken in der Bioinformatik. Die Teilnahme erleichtert die Beteiligung an laufenden DB-Projekten im neuen Bioinformatik-Zentrum der Universität (IZBI) als studentische Hilfkraft oder Diplomand. Themen sind u.a.
Inhalt:
- Einführung / Anforderungen an Bio-Datenbanken
- Sequenzdatenbanken und -analyse
- Microarray-Datenbanken, Genexpressionsanalyse
- Datenintegration von Biodaten
- Data Mining von Biodaten
- Bioinformatik-Unterstützung durch kommerzielle DBS
Termin und Ort
Das Seminar findet Dienstags 15.15 Uhr im HS 4 statt.Beginn: 15.10.02
Leistungsnachweise
Scheinvergabe nach Seminarteilnahme mit eigenem Vortrag und AusarbeitungThemen
| Thema | Betreuer | Bearbeiter | Termin | Ausarbeitung |
|---|---|---|---|---|
| 1. Einführung Bioinformatik / Bio-Datenbanken | D.Sosna | Kühn | 03.12.02 | Ausarbeitung |
| 2. Sequenzanalyse, Suche in Gen-Datenbanken | T.Kirsten | Ausarbeitung | ||
| 3. Überblick Bio-Datenbanken, insb. Gen-Annotations-DB | T.Kirsten | Ausarbeitung | ||
| 4. Genexpressionsanalyse: Verfahren und Datenbank-Anforderungen | H.H.Do | Seemann | 10.12.02 | Ausarbeitung |
| 5. Genexpressionsanalyse: Data Mining-Verfahren | H.H.Do | Schulz | 17.12.02 | Ausarbeitung |
| 5. Genexpressionsanalyse: Data Mining-Verfahren | H.H.Do | Schulz | 17.12.02 | Ausarbeitung |
| 6. Protein-Datenbanken | D.Sosna | Faust | 07.01.03 | Ausarbeitung |
| 7. Pathway-Datenbanken | S.Melnik | Lehmann | 14.01.03 | Ausarbeitung |
| 8. Integration von Bio-Daten | R.Müller | Junick | 21.01.03 | Ausarbeitung |
| 9. Anfragesprachen an Bio-Datenbanken | T.Böhme | Rohrschneider | 28.01.03 | Ausarbeitung |
| 10. Web Services in der Bioinformatik | U.Greiner | Massmann | 04.02.03 | Ausarbeitung HTML PDF |